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西奈山利用美国国立卫生研究院200万美元的拨款建造新的超级计算机用于组学研究

纽约西奈山卫生系统今天说,它正在使用一个200万美元的国立卫生研究院建立一个新的超级计算机来取代现有的一个,并能够处理和分析“大组学”数据的研究。

新系统名为BODE 2,将于今年年底推出,并将取代BODE,该系统曾被西奈山61名基础和翻译研究人员以及其他75家机构的合作者使用。西奈山说,博德使科学发现得以发表在167多份出版物上,三年内共引文2427条。
Mount Sinai称,BODE 2是一款联想ThinkSystem SR360,由3840个Intel Cascade Lake内核组成,内存为15TB,原始存储为14PB,可用存储为11PB。在2.6 GHz的频率下,它将产生大约2800万个核心计算小时,并且每秒的峰值速度为220万亿次,大约是BODE的两倍。

BODE 2将促进的研究项目的一个例子是SPl1依赖性阿尔茨海默病风险机制的研究。BoDE 2将为来自10000多个研究对象的全基因组测序(WGS)数据和处理能力(大约1200万个计算小时)提供必要的存储,以使用机器学习技术来分析数据。
另一个例子是用于精密医学的跨组学(TOPMed)计划,BODE 2将为WGS、其他组学、分子、行为、成像、环境和临床数据提供1.75千兆字节的存储空间,以探索心脏、血液、肺和睡眠障碍的生物学原因。它还将提供中间结果存储所需的数百兆字节和用于TopMe数据的最高功率分析所需的大约700万个计算小时。
“这种规模和速度的计算能力还不广泛,西奈山在建设这一基础设施方面的投资将转化为更强大的遗传学和种群分析、基因表达、机器学习以及结构和化学生物学研究,西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine)科学计算和数据科学高级副院长帕特里夏•科瓦奇(Patricia Kovatch)在一份声明中说:“这项研究为包括老年痴呆症、自闭症、流感、前列腺癌、精神分裂症和药物使用障碍在内的多种疾病带来了新的见解和进展。”。
一年期补助金从七月开始,由国立卫生研究院院长办公室管理。

原创文章,作者:温大人,如若转载,请注明出处:https://www.bilingling.cn/news/33516.html

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