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WeGene 攻城狮瞎放大招!千万位点免费获取,极速升级,只需一小时~

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我厂的生物信息攻城狮神秘兮兮地告诉我,他们这次搞了个很厉害的功能


—— 可以把我的 60 万变成 1000 万


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Lily 正要欣喜若狂地准备去借 60 万高利贷给攻城狮帮我变一下,才发现这 60 万说的是基因位点。


从 2016 年 3 月以来,WeGene 就开放下载 60 万位点的原始数据,检测结果绝对可靠~


而从 2017 年 8 月起,WeGene 可以提供下载的位点升级到 1000 万个了!


是的,每个人的数据都能进行升级!

。。。。


现在问题来了,WeGene 的芯片不是只能检测约 60 万个位点吗?


怎么就变成 1000 万了?


攻城狮一定是欺负我们读的书少。


于是,攻城狮给我出了道题——


    「 Lucy 和 Nana 是一对好闺蜜,她们经常出现在一起,吃饭逛街做美甲;F 君和 X 君是一对好基友,也是天天待在一起,喝酒吹牛打游戏。有一天,你在商场里看到 Lucy,谁最有可能和 Lucy 在一起逛街?」


    「 Nana,因为她们是好闺蜜。」


    「 Bingo!Lucy 和 Nana 总是一起出现,看到 Lucy,就会猜到 Nana 可能就在附近。」

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    「 其实遗传学上也有类似的现象,许多基因位点之间的结果有很强的关联关系这种关系我们称之为『连锁不平衡』。基于这样的原理,当我们检测到某些位点的基因型以后,可以用它们来计算其他没有检测的位点的基因型。当然,实际情况可能要复杂一些,因为基因圈比较乱,通常我们会需要根据一堆位点的检测结果去计算另一个位点,而不仅仅基于一个位点。」

 

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此处应有掌声给我厂攻城狮


也就是说,这 1000 万个位点是根据已有的 60 万个位点计算出来的,这种计算在基因组学领域有个专门的名词 —— 基因型填补(genotype imputation)。是不是听起来有点像高中英语的完形填空,实际上也差不多。英国 UK BioBank 项目、23andme 的香菜喜好项目等都曾应用了这项技术。 


总之,我厂攻城狮采用了一套经过优化的标准科研算法,加上芯片上检测的 60 万个位点是为中国人专门设计的,计算出来的 1000 万个位点准确率可以达到 98%。


    「准确率有 98% ?确定不是吹牛?」

     

    「忘了我们有全基因组的检测了吗,将实际检测结果和计算结果一比对就知道啦。虽然这部分结果还不能用于临床使用,毕竟准确性还不到 100%。但拿去分析更多的性状,或者模拟不同格式的数据去第三方工具那边做分析啥的都是没问题的!」


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刚才攻城狮提到了我们今天的重点——


这些数据有啥用???


很多人之前就看到可以下载原始数据,虽然不是很懂但是好像很厉害的样子,下载一看……


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嗯,就是一堆乱码。


那么 Lily 就来简单举几个例子介绍一下吧~


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用法一:

位点数据可以上传给第三方网站,获取更多的分析和解读结果。比如国外的 SNPedia,国内的一脉基因等都支持 WeGene 的数据上传,WeGene 的一些大神级别的用户也在微解读中提供了许多解读项目。只要拿到自己的基因数据,就可以源源不断地获得更多的项目解读。



用法二:

国外有个网站叫 GEDmatch,上传自己的数据后,你就可以通过基因数据比对,在全世界的范围内找亲戚了。真的有在国外被领养的人通过这个网站找到自己亲生父母的。


 Lily 说

很久之前我们的 CTO 就在社区里贴心地为大家总结好可以支持 WeGene 数据分析和解读的第三方了~

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点击此处直达社区查看该贴。


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那么,把 60 万位点的数据拓展到 1000 万位点后,又会打开些什么新大门呢?


比如,有些姑娘有痛经,WeGene 曾经和上海交通大学合作进行了相关研究项目,他们已经有研究表明,位点 rs76518691 与原发性痛经有显著相关性,论文也已发表到 Nature 子刊上了。《 Common variants in ZMIZ1 and near NGF confer risk for primary dysmenorrhoea 》)


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但是,尴尬的是…


该位点,不在 WeGene 的检测芯片的设计位点中……


这个时候就轮到这 1000 万位点数据出场了,利用拓展数据中的位点信息,我们就可以解锁更多的解读项目啦!


还有像和男性的秃头基因最相关的 20 个基因位点,之前 WeGene 只检测了其中 2 个位点,数据扩展后就可以覆盖几乎所有的位点。


根据 Lily 得到的线报,以上两个项目的解读结果也马上要加入 WeGene 豪华项目解读套餐中了!


而且未来还会出现更多项目~


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此处应该再有掌声给我厂攻城狮!


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那么,这 1000 万个位点的数据要去哪里下载呢?


1. 进入设置 – 账号信息

2. 找到自己的套件,点击 「扩展数据下载」

3. 输入密码并点击下载,等待数据生成

4. 数据准备完成后会收到网站私信通知

5. 再次点击「扩展数据下载」,输入密码就可以进行下载啦


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忍不住想去下载的快点这里去试试吧~


温馨提示:


*下载密码就是登录密码,不记得密码的可以在登录页面通过邮箱找回。


*数据准备时间一般不超过 1 小时,如果同时请求数据生成的人多可能会稍微慢一些。


*建议在电脑端下载哦,1000 万个位点还是很大的~


如果这 1000 万个位点数据还不能满足你,我们还有全基因组测序的服务哦。Lily 同款,仅需 ¥9999,你,值得拥有~


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核心数据&拓展数据下载


WeGene 研究所

女性痛经量表(CMSS)


References:


1.Li, Z., Chen, J., Zhao, Y., Wang, Y., Xu, J., Ji, J., et al. (1AD). Common variants in ZMIZ1 and near NGF confer risk for primary dysmenorrhoea. Nature Publishing Group, 8, 1–7. http://doi.org/10.1038/ncomms14900


2.Hagenaars, S. P., Hill, W. D., Harris, S. E., Ritchie, S. J., Davies, G., Liewald, D., et al. (2016). Genetic Prediction of Male Pattern Baldness. bioRxiv, 072306. http://doi.org/10.1101/072306


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原创文章,作者:DOT日报,如若转载,请注明出处:https://www.bilingling.cn/news/14096.html

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